He leido en varios hilos que bastante gente utiliza programas externos de facturación a magento, pero que son compatibles con magento. Qué programas utilizais? Querría probar alguno para utilizarlo junto con magento.
El OpenERP es la única opción gratis en cuanto a montar la pasarela de conexión. Los demás, por ser magento te cobran. Ahora bien mirate bien como montar el openERP que requiere amor y cariño.