O puedes crearte un pequeño trozo de código y eliminarlo con las funciones de Magento sin tocar directamente las tablas:

	$category = Mage::getModel('catalog/category')->load($categoryId);

	$category->delete();

	

Eliminiacion de categoría

Pero y si quiero guardarme la categoría??? por que así la eliminaria completamente verdad?? Bueno mi idea es un temporizador que me desactive la categoría pasado un tiempo que yo le indique. Sabemos de alguna extensión que me de algo parecido???
Buscando he encontrado Esto , pero claro antes de añadirle el atributo pues me gustaría hacerlo bien, sabe alguien cual es el tipo para que te muestre la cajetilla como si fuera una fecha?? como por ejemplo el que podemos ver en diseño personalizado también dentro de la gestión de la categoría

Me contesto:
Lo encontré por fin, lo pongoen este enlace por si le interesa a alguien.

Había una extensión gratuita que permitía añadir atributos a las categorías.
En principio no funcionaba, pero dentro del foro de la misma extensión o en los comentarios, no recuerdo, aparecía que cambiar para que funcionase y tenías un gestor de atributos bastante comodo.

Vaya, lo hice a la vieja escuela xd, por cierto como es la extensión? para facilitame un poco la vida xd